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1、war是一个web模块，其中需要包括WEB-INF，是可以直接运行的WEB模块；jar一般只是包括一些class文件，在声明了Main_class之后是可以用java命令运行的。

2、war包是做好一个web应用后，通常是网站，打成包部署到容器中；jar包通常是开发时要引用通用类，打成包便于存放管理。

3、war是Sun提出的一种Web应用程序格式，也是许多文件的一个压缩包。这个包中的文件按一定目录结构来组织；classes目录下则包含编译好的Servlet类和Jsp或Servlet所依赖的其它类（如JavaBean）可以打包成jar放到WEB-INF下的lib目录下。

JAR文件格式以流行的ZIP文件格式为基础。与ZIP文件不同的是，JAR 文件不仅用于压缩和发布，而且还用于部署和封装库、组件和插件程序，并可被像编译器和 JVM 这样的工具直接使用。

格式特点

安全性

可以对 JAR 文件内容加上数字化签名。这样，能够识别签名的工具就可以有选择地为您授予软件安全特权，这是其他文件做不到的，它还可以检测代码是否被篡改过。

减少下载时间

如果一个 applet 捆绑到一个 JAR 文件中，那么浏览器就可以在一个 HTTP 事务中下载这个 applet 的类文件和相关的资源，而不是对每一个文件打开一个新连接。

压缩 JAR 格式允许您压缩文件以提高存储效率。

传输平台扩展 Java 扩展框架（Java Extensions Framework）提供了向 Java 核心平台添加功能的方法，这些扩展是用 JAR 文件打包的（Java 3D 和 JavaMail 就是由 Sun 开发的扩展例子）。

WAR文件就是一个Web应用程序，建立WAR文件，就是把整个Web应用程序（不包括Web应用程序层次结构的根目录）压缩起来，指定一个war扩展名。

建立的条件

需要建立正确的Web应用程序的目录层次结构。

建立WEB-INF子目录，并在该目录下建立classes与lib两个子目录。

将Servlet类文件放到WEB-INF\classes目录下，将Web应用程序所使用Java类库文件（即JAR文件）放到WEB-INF\lib目录下。

将JSP页面或静态HTML页面放到上下文根路径下或其子目录下。

建立META-INF目录，并在该目录下建立context.xml文件。